服务介绍

lnc RNA测序      

       长链非编码RNA（long no-coding RNA, lncRNA）是一类长度大于200 nt且不表现出蛋白质编码潜能的RNA，参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，涉及到表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等多个层面。lncRNA测序使用特定方法（如采用Ribo-OffTM系列Kit）降低样本中rRNA的丰度，对富集到的RNA进行文库构建，然后，利用高通量测序产出的数据进行信息分析，能够快速全面、准确地获得与特定生物学过程（例如发育、疾病等）相关lncRNA的信息。

       本公司拥有一流的 lnc RNA测序技术，我们的测序结果拥有以下优点：1.重复性好：同一样本重复建库相关性pearson值大于0.993；2.序列完整：基于高通量测序技术，能够一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息；3．分析严谨：不局限于对已知lncRNA的研究，还能够进行新lncRNA预测；4.物种多元：能够对包括人类、动植物在内的许多物种的lncRNA进行分析和预测；5.关联全面：能够结合mRNA以及small RNA数据，进行多方位的调控关联分析。

服务内容

1.RNA抽提及测序

2.标准信息分析：

    1）.测序数据质控；

    2).rRNA比对分析；

    3).基因组比对分析；

    4).样品lncRNA预测；

    5).样品转录本覆盖统计分析；

    6).表达量分析；

    7).差异基因筛选；

    8).组间差异基因筛选；

    9).表达模式聚类分析；

    10).基于碱基配对的lncRNA-mRNA互作分析；

    11).基因上下游lncRNA的注释；

    12).miRNA前体预测；

    13).lncRNA家族预测。

3.个性化信息分析（需要有mRNA以及smallRNA分析结果）：

    1).mRNA；

    2).smallRNA；

    3).LncRNA联合分析。

服务说明

      1．样品类型：去蛋白并进行Dnase处理后的完整无污染总RNA；

      2．样品需求量：≥5 μg；

      3．样品浓度：≥200 ng/μl；

      4．样品纯度：OD260/OD280在1.8-2.2之间，OD260/OD230≥2.0，28S/18S≥1.0， RIN≥7.0， RNA无明显降解；

      5．样品保存：请选择乙醇、DEPC水保存样品，并在样品信息单中注明，请勿反复冻融；

      6.  数据量：6-8G clean data/样本；

      7．项目运转周期：标准流程的运转周期为约45个工作日；

      8.  若另有疑问欢迎向本公司咨询，我们将竭诚为您服务。

质量承诺

      1. 准确可靠的lnc RNA测序结果；

      2. 专业权威的lnc RNA测序分析报告；

      3. 真实的原始实验数据；

      4. 详细的实验步骤。